Designada por Santa Casa da Misericórdia de Tavira, ou apenas Misericórdia de Tavira, foi fundada em 1498 e constituída na ordem jurídica canónica, com o objetivo de satisfazer as carências sociais e praticar atos de culto católico de harmonia com o seu espírito tradicional, informado pelos princípios da doutrina e moral cristã.
Sedeada inicialmente numa capela lateral à Igreja Conventual de São Francisco, mudou-se para o antigo Hospital em 1541, altura em que mandou construir a Igreja da Misericórdia.